黑甜玉米营养价值大，微量元素含量高，是其它谷物的2-8倍，赖氨酸含量高达0。45%，为高赖作物。据专家分析其属于改变了玉米胚乳蛋白质的氨基酸组成模式的变种，赖氨酸含量显著增加，使其蛋白质营养质量大幅度提高。黑甜玉米含有18种以上氨基酸，其八种必需氨基酸组成比例与含量完全符合联合国粮农组织与世界卫生组织所提出的"理想蛋白质"模式，故其营养价值可与动物性蛋白质相媲美，是素食者的理想食品。